Faire un rsync avec roulement de 3 jours.
Perso, je préfère rdiff-backup, qui permet de faire une sauvegarde sur bien plus longtemps, économise énormément de place et qui permet de demander un fichier particulier à une date donnée.
Bonus de rdiff-backup: il peut sauvegarder les droits même sur des systèmes de fichiers non-POSIX (par exemple pour sauvegarder vos fichiers sur partition ext4 vers un disque externe FAT ou même NTFS.)
Pour faire simple, rdiff-backup se comporte comme rsync, mais garde en prime x versions antérieures de vos fichiers.  Par un diff binaire, il n'enregistre que les différences (ainsi si seulement 2 ko sont modifiés dans un fichier de 500 Mo, seuls ces 2 ko seront enregistrés. Il est donc très économe en place pour enregistrer plusieurs versions d'un même fichier.)
http://www.nongnu.org/rdiff-backup/