Pour faire mes backups sous Windows vers mon disque externe, j'ai remplacé tous les logiciels de backup par rsync. Tous les freewares de backup que j'ai pu trouver sous Windows (FBackup, DirSyncPro, SyncBak, CreateSynchronicity...) ne me conviennent pas: Pas pratiques, ou trop lents, ou pas les options ou le fonctionnement que je souhaite. Rien à faire, rien ne bat rsync (sauf rdiff-backup ;-).
rsync est l'un des logiciels que je considère comme l'une des merveilles du logiciel (avec ssh, gzip/deflate, gpg et quelques autres). Non sérieusement, on devrait leur faire un autel tellement ils rendent de services inestimables à l'informatique moderne.

EDIT: Laurent L. me suggère Cobian Backup (http://www.cobiansoft.com/cobianbackup.htm). De ceux que j'ai essayé, c'est celui qui tiendrait le plus la route.