Oups.. oh merde. Il fallait que ça arrive: Deux clé GPG ont un identifiant unique.
En soit ce n'est pas vraiment un problème car il faut toujours de toute manière contrôler la clé (identifiant long ou fingerprint), mais il faut juste le savoir.
Voir aussi:
http://www.asheesh.org/note/debian/short-key-ids-are-bad-news.html (merci à Arnaud pour le lien)