Si par hasard vous avez une application lancée via Flatpak et que vous voulez qu'elle puisse lancer, par exemple, un script shell voici ce qu'il faut faire:

1) modifier le lanceur de l'application (flatpak run) pour ajouter l'option:  --talk-name=org.freedesktop.Flatpak
2) dans l'application, au lieu de lancer:
/chemin/monscript
faites:
flatpak-spawn --host /chemin/monscript