Cet article parle du problème avec Flatpak, Snap et autres systèmes de packaging multi-distributions (AppImage étant le moins pire de tous).
Moins pire, mais pas bon pour autant: 150 Mo pour KCalc, une simple calculatrice.
La même chose en Flatpak : 900 Mo.  NEUF CENT MEGA OCTETS TELECHARGÉS pour faire tourner une calculatrice dont l'exécutable fait 4,4 Mo.
Voilà pourquoi tant que possible, préférez les applications packagées spécifiquement pour votre distribution (.deb, .rpm ou autres).
Personnellement, je tolère encore AppImage, mais j'ai déinstallé Snap de mes Ubuntu.

Et la place occupée par ces système de packaging n'est pas le seul problème. Cet article en fait le tour.