TimeVault permet de faire des snapshot de répertoire et permet de récupérer des fichiers tels qu'ils étaient dans le passé. S'intègre à Nautilus (le navigateur de fichiers d'Ubuntu et Gnome).
Duplicity est un formidable logiciel de backup: Backup incrémental (seules les parties modifiées sont envoyées), support répertoire local, ssh, FTP... et les backups sont chiffrés avec GPG. Voir http://tinyurl.com/39db64 et http://tinyurl.com/okxxn